Workshop taxonomique
Le genre Nitzschia, 1ère partie
A la suite du colloque annuel de l'ADLaF, du jeudi 10 septembre midi au vendredi 11 septembre midi, aura lieu le workshop taxonomique consacré à la reconnaissance en microscopie optique et en microscopie électronique à balayage (MEB) des espèces du genre Nitzschia en Europe animé par Bart Van de Vijver (Jardin Botanique Meise, Belgique) et co-organisé avec Carlos E. Wetzel (LIST).
Les deux demi-journées s'articuleront autour de cours théoriques sur les dernières évolutions taxonomiques et une partie pratique avec observation microscopique. Les derniers résultats obtenus dans le domaine de la recherche seront présentés.
Il aura lieu dans l'amphithéâtre 219 de la Maison des Sciences Humaines (4 rue Ledru 63000 Clermont-Ferrand), le jeudi 10 septembre de 14h00 à 18h00 pour la partie théorique et le vendredi 11 septembre de 9h00 à 12h00 pour la partie observation microscopique.
Chaque participant est invité à amener des lames contenant les espèces étudiées (de préférence en dominance) pour utiliser ces lames comme document de travail et d'illustrations. Le Professeur Van De Vijver aura également en sa possession des lames contenant les espèces qu'ils nous présentera lors de cette journée.
Le prix par personne est de 225 euros (115 euros pour les étudiants). Le règlement des frais d'inscription se fera directement en même temps que votre inscription au colloque avec les mêmes modalités d’inscription.
L’Association déclarée loi du 1er juillet 1901, est non assujettie à la TVA. article 293 B du CGI
Le nombre de participants est limité à 30 personnes. Les réservations se feront dans l'ordre des inscrits.
Autres workshops
Cette année, l'association vous propose également deux autres workshop thématique au choix qui auront lieu le lundi 7 septembre (lieu exact à définir).
* Mesure de la fluorescence de la chlorophylle
animé par Benoît Schoefs (BIOSSE) et Isabelle Mary (LMGE), avec pour objectif : 1) Comprendre comment à partir de la mesure de la fluorescence de la chlorophylle, l’activité photosynthétique est évaluée; 2) Comprendre comment l’énergie absorbée est gérée par les chloroplastes; 3) Réaliser et analyser des mesures.
Une fraction de l’énergie absorbée par la chlorophylle n’est pas utilisée pour la photosynthèse et est réémise sous forme de fluorescence. L’intensité de l’émission de la fluorescence varie dans le temps en fonction des conditions environnementales. Du point de vue de la physiologie des organismes photosynthétiques, ces variations reflètent la manière dont ils gèrent l’énergie absorbée
La journée de formation se découpe en deux temps :
(1) une description théorique de la photosynthèse, de la fluorescence de la chlorophylle et de l’utilisation des variations de l’intensité de la fluorescence pour la mesure de l’activité photosynthétique et la gestion du stress (2-3h)
(2) travaux pratiques sur des échantillons proposés et/ou apportés par les participants eux-mêmes.
Ce workshop aura lieu le lundi 7 septembre 2026 de 11h à 18h. Frais d’inscription : 60 € HT par participant (TVA non applicable)
Ce prix comprend l’accès au workshop, le polycopié de la présentation et le repas de midi et la pause café.
* Métabarcoding diatomées : clés de lecture et bonnes pratiques pour mieux comprendre ses inventaires
Avec l’essor et le déploiement opérationnel du métabarcoding, de plus en plus d’acteurs produisent et/ou interprètent des inventaires génétiques et taxonomiques (ADNe) produits à partir de biofilm aquatique pour caractériser les diatomées benthiques. En l’absence d’un cadre clair permettant d’identifier les bonnes pratiques ou les informations réellement pertinentes associées à la production de ces inventaires, il peut être difficile d’interpréter les résultats obtenus. Ce workshop d’une demi‑journée vise à apporter des éléments de réponse à ces besoins.
Animé par Valentin Vasselon (SCIMABIO INTERFACE).
1) La première partie du workshop proposera un volet pratique sur l’analyse bioinformatique de données de métabarcoding, en mettant l’accent sur les paramétrages clés pouvant affecter les inventaires génétiques et taxonomiques produits (paramètres de PCR/séquençage, base de référence, assignation taxonomique). L’objectif est que les participants acquièrent des réflexes de base pour interpréter des données issues du métabarcoding.
2) La seconde partie sera consacrée à un temps d’échange interactif autour des retours d’expérience des participants et de leurs propres données lorsqu’ils en disposent. L’objectif est d’identifier collectivement les points bloquants sur différents types de données afin de renforcer la capacité de chacun à analyser et interpréter ses résultats. Au besoin, les participants pourront envoyer leurs données et problématiques en amont du workshop à l’animateur pour faciliter les échanges le jour J. »
Frais d’inscription : 300 € HT par participant (TVA non applicable)
Ce workshop aura lieu le lundi 7 septembre 2026 de 13h à 18h.
Ce prix comprend l’accès au workshop, le polycopié de la présentation et la pause café.